途径疫情地区行程码不会变色。根据国务院通信行程卡规则，行程卡记录个人行程城市，需在某城市停留超过4小时才会记录，如果途径时间短于4小时，是不会被记录的。

行程码：

行程码就是通信大数据行程卡一个码也相当于健康码，是由中国信通院联合中国电信、中国移动、中国联通三家基础电信企业利用手机接收的数据，通过用户手机所处的基站位置获取，为全国16亿手机用户免费提供的查询服务，手机用户可通过服务，查询本人前14天到过的所有地市信息。